تتولي إدارة التعاون العربي - باعتبارها أحد الإدارات التابعة للإدارة العامـة للعلاقات الدوليـة بالعلاقات الزراعية الخارجية - القيام بالمهام المنوطة بها من تعزيز و تنسيق التعـاون الزراعي مع الدول العربية الشقيقة كشكل من أشكال تكامل علاقات التعاون الوثيقة بين الدول العربية ، و يتم ذلك بالتنسيق مع سفارات الدول العربية بمصر و السفارات المصرية بالدول العربيـة خاصة في مجـال التنمية الزراعيـة المستدامة و مكافحة التصحر و استصلاح الأراضي في قلة الموارد المائية في دول العالم العربي.

و يتم ذلك من خلال إبرام الاتفاقيات و مذكرات التفاهم الدولية و الثنائية الجانب – تمثيل وزارة الزراعة المصرية في إعداد و حضور اجتماعات اللجان المشتركة للتعاون الزراعي الفني و الاقتصادي و العلمي علي اختلافها و التي تنعقد بمعرفة وزارة التعاون الدولي و وزارة الخارجية ، مع متابعة اتخاذ الإجراءات التنفيذية الخاصة بمحضر الاجتماعات الختاميـة لتلك اللجان و التي تم الاتفاق عليها – إعداد و تنفيذ برامج التعـاون و التبادل الفني الزراعـي- تولي شئـون مقابلة و مرافقـة وفود الزوار العرب.

بالإضافة إلي تلك المهام تختص إدارة التعاون العربي بالمهام التالية:

•     تدعيـم التعاون الزراعي مع الدول العربية خاصة لما تتميز به مصر من مكانة تاريخية بين دول العالم العربي و ما يربطها من علاقات وثيقة بهذه الدول تسعي إلي تدعيمها علي كافـة المستويات و خاصة علي المستوي الاقتصادي و الذي يعتبر الجانب الزراعي منه هو محور الاهتمام الأول بين الدول العربية. 
•      التنسيق مع الجهات المعنية بوزارة الزراعة المصرية لتلبية احتياجات الدول العربية سواء توفير البذور و التقاوي أو الشتلات لبعض المحاصيل الزراعية أو توفير البرامج التدريبية لبعض الكوادر الفنية بتلك الدول ، و ذلك في إطار تطوير التعاون في المجالات الزراعية المختلفة مع الدول العربية الشقيقة و تنفيذا لمحاضر اجتماعات اللجان المشتركة.
•      من خلال اللجان المشتركة بين مصر وبعض الدول العربية ، يتم التنسيق من أجل فتح أسواق جديدة لبعض السلع الزراعية المصرية الى أسواق بعض البلاد  العربية و رفع الحظر المفروض علي بعض السلع ، فعلى سبيل المثال نجحت الادارة فى رفع الحظر التى كانت تفرضه كل من السلطات السورية والاردنية على الصادرات المصرية من المانجو والجوافة المصرية ، و كذا في فتح السوق الأردني لمنتج البيض المبستر المصري.